Berikut adalah daftar kampus terbaik di NTT berdasarkan peringkat nasional mereka:
1. Universitas Nusa Cendana (UNDANA) Kupang,
Rangking Nasional: 126
2. Universitas Timor (UNIMOR) Kefamenanu,
Rangking Nasional: 206
3. Universitas Muhammadiyah Kupang,
Ranking Nasional: 244
4. Politeknik Pertanian Negeri Kupang,
Ranking Nasional: 328
5. Universitas Katolik Widya Mandira (UNWIRA) Kupang,
Ranking Nasional: 393
6. Universitas Nusa Nipa Maumere,
Ranking Nasional: 436
7. Universitas Kristen Wira Wacana Sumba,
Ranking Nasional: 448
8. Poltekkes Kupang,
Ranking Nasional: 478
Baca Juga: Rapat Kerja Jasa Konstruksi Dorong Mutu Penyelenggaraan dan Pertumbuhan Ekonomi Pelaku Usaha di NTT
9. Universitas San Pedro Kupang,
Ranking Nasional: 545
10. Universitas Katolik Indonesia Santu Paulus Ruteng,
Ranking Nasional: 611
11. Universitas Flores (UNIFLOR),
Ranking Nasional: 634
12. Institut Agama Kristen Negeri (IAKN) Kupang,
Ranking Nasional: 932
13. Sekolah Tinggi Pastoral Atma Reksa (STIPAR) Ende,
Ranking Nasional: 968